연구자라면 많은 논문들을 읽게된다. 요즘은 대부분의 저널이 온라인저널형태로 운영되고 있기 때문에 인터넷을 통해서 논문을 pdf파일형식으로 다운로드 받아서 자신의 컴퓨터에 저장해놓고 보는 일이 일상적이다. 하지만 몇달만 지나면 저장해놓은 논문들이 수백편을 넘어가게 되고, 그 가운데서 이전에 저장해놓은 논문을 다시 찾기는 힘들어진다. 논문 검색을 쉽게하기 위해서 주제별로 다른 디렉토리에 저장해보기도 하고, 파일이름에 저자명이나 논문제목을 붙여 놓기도 하지만 그리 큰 도움은 되지 않는다. 내 경우에도 논문들을 한 디렉토리에 [저널명]-[볼륨]-[첫페이지].pdf 형식으로 저장하고 구글데스크탑을 이용해서 검색하고 있지만, 논문에 대한 기록을 남겨 놓지 않는 이상 몇편의 pdf 파일을 뒤적거린 후에야 원하는 논문을 찾을 수 있다.

이런 문제는 파일 이름이 논문의 내용을 대표하지 못하고 검색 자체도 문맥을 파악하지지 못하기 때문이다. 논문 관리에 태그를 이용한다면 간단하게 문제를 해결할 수 있다. 실제로 태그를 이용하는 프로그램들이 몇 가지 있었다.

Yep은 iphoto와 비슷한 인터페이스를 가지고 있는 프로그램으로 현재 $34에 팔고 있는 상용프로그램이다. 굉장히 깔끔한 인터페이스를 보여주고 있다. 태그기능과 평가기능을 비록해서 상용프로그램답게 몇가지 부가기능도 갖추고 있는 것으로 보인다. 아쉬운 점은 맥OS에 기반하기 때문에 맥유저가 아니라면 사용할 수 없다는 것이다.

Papers도 iphoto와 비슷한 인터페이스를 가지는 프로그램으로 논문관리에 더욱 특화되어 있다. 약 $25에 라이센스를 구입해야만 사용이 가능하고 역시 맥OS에 기반하기 때문에 맥유저가 아니라면 사용할 수 없다. 이 프로그램은 특히 PubMed 직접 검색해서 논문 관련 정보를 찾아오기 때문에 생물학 관련 논문관리에 가장 유용하게 사용할 수 있는 프로그램이다. 개인적으로는 바이오인포매틱스를 전공하는 대학원생이 만들었다는 점에서 나에게 더욱 적합한 프로그램이라고 예상된다. 하지만 역시 $25+(맥가격)이라는 이중 부담때문에 그림에 떡일 수 밖에 없다.

Connotea는 웹 기반 프로그램으로 del.icio.us와 비슷한 형태의 웹 2.0 사이트이다. Nature Publishing Group에서 운영하고 있고, 간단한 등록절차만 거치면 무료로 사용 가능하다. del.icio.us와 비슷하게 검색된 논문페이지에서 브라우저 버튼을 누르면 태그와 함께 논문을 등록할 수 있다. 물론 로컬에 저장된 pdf 관리에는 사용할 수 없지만, 웹상에서 사용가능하고 링크를 저장한다는 점은 접근성과 이동성에서 한층 뛰어나다고 볼 수 있다. 특히 논문 리스트를 EndNote에서 읽을 수 있는 파일형식으로 저장하는 기능과 웹의 특성을 살려서 다른 사람들이 저장 논문 리스트를 볼 수 있다는 점에서 다른 프로그램과 구분되는 유용성을 확인할 수 있다.

위에서 살펴본 프로그램은 모두 뛰어난 기능과 손쉬운 UI를 동시에 갖추고 있다. 하지만 앞서 언급한 Yep과 Papers는 맥에서만 사용이 가능하고 Connotea는 pdf파일 관리에 사용할 수 없기 때문에 내가 사용하기에는 부족하다. 따라서 내가 필요한 기능을 가지는 프로그램을 구현해야 할 필요가 있다.